产品中心
PRODUCT CENTER
产品介绍
Geneious
满足世界领先的生物信息学软件平台
Geneious是由Biomatters开发的一款分子生物学和NGS分析软件，该软件包括从基础的分子生物学到序列分析的工具，特别适用于诊断抗体研发生物信息学软件方案。Geneious提供组织所需的所有分子生物学和序列分析工具。无论您是希望提高生产率、提高可见性和洞察力，还是减少错误和风险，我们的平台都会解锁您实验室数据的价值。
序列分析
Sanger和 NGS的可视化（宏基因组、RNA-seq），序列拼接，查找SNP，基因组注释，DNA序列及蛋白质序列的统计、预测等，查找Motif、ORF，比对序列与构建进化树等功能。
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自动基因组注释 根据公共或本地数据库中的现有模式和注释自动注释新基因组，包括根据这些模式将 ORF 注释为假设基因，并针对 NCBI 进行查询。 |
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实时序列预测 对DNA和蛋白质序列进行翻译，预测分子量、等电点、疏水性、跨模结构域等。 |
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NGS可视化 只需单击一下，即可获得您拥有的下一代测序数据所需的可视化效果。注释的基因组，循环基因组，映射的读取，重叠群都显示在我们高度可定制的序列视图中。选择要显示的其他批注的配色方案、图形和轨迹，然后使用动态批注搜索和位置跳转来查找所需内容。 |
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转录组数据分析 从映射的读数中计算表达水平，然后在样品之间进行成对比较，以鉴定差异表达的基因。在统计编程语言R方面没有任何专业知识的情况下，使用行业标准的DESeq2包来比较两个条件之间的表达式，每个条件都有重复样本。 切换到 PCA 图选项卡以使用主成分分析检查数据的质量，然后切换到交互式火山图以发现感兴趣的基因。在火山图中选择一个基因后，您可以在序列视图中直接跳转到该基因，其中所有基因都具有基于差异表达的热图着色。 |
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序列拼接 可以处理来自任何类型的测序机器的数据，读取任何长度的读数，包括配对读取和来自不同测序机器的混合读取。它特别适用于具有产生圆形重叠群的独特能力的微生物组件。 |
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序列比对 使用如Clustal Omega、MUSCLE、MAFFT等多种比对方式将序列进行对齐分析。 |
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系统发育进化树构建 使用多种算法对目的序列构建进化树，如MrBayes、Neighbor Joining、UPGMA、PhyML。 |
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分子生物学
自动注释质粒图谱、模拟分子克隆（优化密码子），引物、探针的设计及特异性分析监测，定位CRISPR位点、分析基因编辑结果，分析SSR序列等。
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分子克隆 自动注释质粒/表达载体图谱，模拟Golden Gate、In-Fusion、Gibson、Gateway等多种分子克隆方法，优化密码子去除冗余酶切位点。 |
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引物设计 直接在Geneious序列查看器中的比对和组装体上设计PCR和测序引物以及杂交探针，以定位任何靶区或整个序列。还可以根据发卡结构，引物二聚体等结果筛选引物，对引物进行特异性检测，将脱靶信息添加到新的引物注释中。 |
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CRISPR gDNA 设计 专为CRISPR设计的强大软件可以快速轻松地找到站点，设计指南RNA并分析您的编辑结果，定位CRISPR靶位点，并在基因组或独立基因序列的选定区域内对其进行评分，自动识别 CRISPR 最佳位点。 |
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