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Discovery Studio “小灶”培训班 | 7月25日第2期:助力天然酶的合理设计


  

Discovery Studio “小灶”培训班

7月25日第2期:助力天然酶的合理设计

 

 

 

 

 

活动介绍 

 

 

自然发生的化学反应通常非常缓慢,或者在可操作的条件下反应速率等不能满足实际过程的需求,因此需要催化剂降低化学反应的活化能来将感兴趣的反应过程大幅度加速,从而使化学反应在速率和选择性等诸多方面得到显著加强。而酶使自然界经过漫长演化而形成的生物催化剂,在生命体内快速且高效地催化各种与生命活动相关的各种化学反应。但是生物催化在实际运用中存在各种问题,譬如酶自身稳定性低,酶催化底物范围和反应类型有限,催化活性和与底物亲和力低等问题,因此需要通过酶工程对酶进行设计改造来完善上述问题。

 

本次培训课程将为大家带来对Discovery Studio软件的深入学习,认识酶了解酶,通过Discovery Studio软件对酶分子中的一个或多个位点的氨基酸残基突变,实现酶性能的显著提升。

 

 

 

 

活动时间

 

7月25日 09:00-17:00

 

 

 

 

培训内容

 

 

 

1.酶的序列分析及三维结构预测

 

对酶进行翻译后修饰预测,基本性质计;选择合适的模板通过同源建模预测目标酶蛋白的三维结构,并对预测结构进行验证保证其立体化学质量。

 

2.酶与小分子底物相互作用预测

 

通过CDOCKER或Flexible Docking等半柔性或柔性分子对接手段预测酶与小分子结合位点的空间匹配,从而预测潜在的酶-底物相互作用,识别热点氨基酸。

 

3.酶与大分子底物相互作用预测

 

通过ZDOCK刚性对接预测酶和蛋白质、核酸底物的结合位点及结合表面的相互作用氨基酸分析。

 

4.基于亲和力和稳定性对酶理性设计

 

基于酶蛋白-底物相互作用复合物模型进行虚拟丙氨酸扫描和饱和突变,基于突变能指导亲和力成熟、稳定性分析,或引入新的二硫键来提高酶的稳定性。

 

 

 

培训讲师

 

 

吴海龙 东方科软BIOVIA生命科学技术工程师

 

主要从事生命科学相关的理论计算研究,精通Discovery Studio 软件。参与多项药物筛选及设计、活性药物反向找靶、抗体亲和力成熟及人源化等项目工作。领域涉及医药、农药、环境、食品等众多行业,拥有多年药物分子模拟经验,曾为多家高校和企业培进行培训。

 

 

 

参与对象

 

Discovery Studio软件分子模拟软件使用者:初学者、科研工作者、资深专家均可参加。

 

 

 

 

报名方式

 

参与方式 参与方式 二维码
线下参与

参与线下培训,请扫码填写报名表,选择参加Discovery Studio 软件第2期培训,等待工作人员联系即可。

*参与人员请自备电脑,若需安装最新版软件,请于开班前到培训地点处理。

*交通、住宿等费用自理。

线上参与

参与线上培训,请点击链接报名或扫描右方二维码。

报名链接:https://ndkja.xetlk.com/sl/1eF5P
*线下有互动实操环节,线上直播无,请根据自己的实际情况报名。

 

 

*本次活动最终解释权归东方科软(北京)科技有限公司所有。

 

 


 

 

Materials Studio 年度培训主题

 

Materials Studio 常用模块讲解

· 第1期:Materials Studio入门-Visualizer与Amorphous Cell模块探索(6月)

· 第2期:分子动力学模拟的利器-Forcite模块详解(7月)

· 第3期:第一性原理计算的核心-CASTEP模块应用(8月)

· 第4期:量子化学计算体验-DMol3模块详解(9月)

· 第5期:自动化脚本与数据处理-Perl模块的应用(10月)

· 第6期:多尺度模拟的新视野-Mesocite模块解析(11月)

· 第7期:探索吸附过程-Adsorption Locator与Sorption模块应用(12月)

 

 

 

 

 

欢迎您的参与和关注!

 

 

 

 

 

 

 

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